Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eme2Q56A04 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms