Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms