Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms