Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms