Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms