Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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