Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms