Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6899Q3USS0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6899Q3USS0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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