Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms