Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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D13Ertd608eQ3UPR8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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