Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms