Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms