Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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