Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LbrQ3U9G9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms