Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U595 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U595 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U595 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U595 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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