Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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