Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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