Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraddQ3U0V2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraddQ3U0V2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraddQ3U0V2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraddQ3U0V2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraddQ3U0V2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraddQ3U0V2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TraddQ3U0V2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraddQ3U0V2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms