Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms