Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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