Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms