Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VgfQ0VGU4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms