Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ttc39dQ0VF76 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc39dQ0VF76 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ttc39dQ0VF76 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ttc39dQ0VF76 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ttc39dQ0VF76 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Ttc39dQ0VF76 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Ttc39dQ0VF76 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Ttc39dQ0VF76 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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