Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms