Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab42Q0PD08 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms