Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms