Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms