Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms