Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms