Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms