Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms