Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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