Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a1Q05722 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms