Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms