Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnb1Q03717 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms