Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms