Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms