Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms