Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms