Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbp1Q01514 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms