Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms