Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IhhP97812 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IhhP97812 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IhhP97812 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms