Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
rp9P97762 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
rp9P97762 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
rp9P97762 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
rp9P97762 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
rp9P97762 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
rp9P97762 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
rp9P97762 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
rp9P97762 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
rp9P97762 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
rp9P97762 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
rp9P97762 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
rp9P97762 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms