Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2cP97760 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2cP97760 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2cP97760 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2cP97760 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2cP97760 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Polr2cP97760 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2cP97760 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2cP97760 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2cP97760 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms