Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms