Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms