Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp1P97350 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms