Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Otx2P80206 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms