Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shox2P70390 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shox2P70390 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shox2P70390 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms