Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms